LAshow - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

LAshow - afișează aliniamentele locale din fișierele .las

REZUMAT

LAshow [-caroUF] [-iint(4)] [-wint(100)][-bint(10)] src1:db|dam [src2:db|dam] align:las
[citește: FILE | citește:gamă ... ]

DESCRIERE

LAshow produce o listă tipărită a aliniamentelor locale cuprinse în .las specificat
fișier, de unde provin citirile a și b src1 sau de la src1 și src2, respectiv. În cazul în care o
este dat fișierul sau lista de intervale de citire, apoi numai suprapunerile pentru care se află a-read
se afișează setul specificat de fișier sau listă. Vedea DBshow(1) pentru o explicație a
cum sunt interpretate fișierul și lista intervalelor de citire.

OPŢIUNI

-F Inversați rolurile citirilor a- și b- de pe afișaj

-U Folosiți majuscule pentru secvența ADN în loc de literele minuscule implicite

-izimțuire
Setați indentarea pentru desenele animate și/sau afișajele de aliniere, dacă acestea sunt solicitate.
(implicit: 4)

-bnum_simboluri
Setați numărul de simboluri de pe fiecare parte a segmentelor aliniate într-un aliniament
afişa. (implicit: 10)

-ww Acest parametru este utilizat pentru modurile de afișare specificate de -a și -r. (Mod implicit:
100)

-o Afișați numai aliniamentele care sunt suprapuneri adecvate, adică unde se termină o secvență
apare la fiecare capăt al aliniamentului

DISPLAY MODURI
-c Redarea desenului animat a aliniamentului

-A, -r Afișează o aliniere a alinierii locale

-a opțiunea pune exact w coloane pe segment al afișajului, în timp ce -r opțiune
pune exact w a-citește simboluri în fiecare segment al afișajului. The -r modul de afișare este
util atunci când se dorește să compare vizual două aliniamente care implică aceeași a-read. În cazul în care o
combinație a -c, -a, și -r steagurile sunt puse, apoi desenul animat vine primul, apoi -a
alinierea, și în sfârșit -r aliniere.

Utilizați LAshow online folosind serviciile onworks.net