Aceasta este comanda libscanoute care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
libscanout - Citește un fișier DHF și scrie un fișier cu clase, pliuri și
Superfamilii.
REZUMAT
libscanout -dhfinfile infile -outfile outfile
libscanout -Ajutor
DESCRIERE
libscanout este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul (grupurile) de comandă „Proteine: Structură 3D”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-dhfinfile infile
Această opțiune specifică locația fișierului DHF (fișier de accesări de domeniu) (input). A
„Fișierul de accesări ale domeniului” conține accesări ale bazei de date (secvențe) cu clasificarea domeniului
informații, în formate FASTA sau EMBL. Hiturile sunt rude cu o familie SCOP sau CATH
și sunt găsite dintr-o căutare a unei baze de date de secvențe. Fișierele care conțin accesări preluate de
PSIBLAST sunt generate utilizând SEQSEARCH.
Necesar secțiune
producție secțiune
-outfile outfile
Această opțiune specifică locația fișierului rezumat (ieșire). Dosarul rezumat
conține liste de clase de domenii, superfamilii și familii, ordonate pe bază
de scor (cel mai mare scor mai întâi).
Utilizați libscanoute online folosind serviciile onworks.net