Aceasta este comanda ltrsift care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
ltrsift - o interfață grafică pentru postprocesare și clasificare a LTR
candidati retrotranspozon
REZUMAT
ltrsift
DESCRIERE
LTRsift este un instrument grafic de desktop pentru postprocesarea semi-automată a predicțiilor de novo
Adnotări retrotranspozon LTR, cum ar fi cele generate de LTRharvest și LTRdigest.
CONFIGURARE
Binarele LAST (lastal și lastdb) ar trebui să fie localizate în calea de căutare a sistemului. Dacă ei
nu sunt, este posibil să le specificați locația folosind mediul „GT_LAST_PATH”.
variabilă înainte de a rula LTRsift. Același lucru este valabil și pentru locația BLAST. Utilizare
``GT_BLAST_PATH” pentru a specifica calea completă către executabilul „blastall”.
Fișierele de stil (care descriu cum arată diagrama liniară a caracteristicilor candidate) pot fi
setat prin variabila de mediu LTRSIFT_STYLE_FILE. Este construit un stil implicit sensibil
în LTRsift.
Utilizați ltrsift online folosind serviciile onworks.net