Aceasta este comanda maskAlignedReads care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
maskAlignedReads.py - Mască citirile aliniate în fișierul regiuni
DESCRIERE
utilizare: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Utilizați in.cmp.h5 pentru a masca regiunile corespunzătoare ale fișierelor în in.rgn.h5, scrieți rezultatul într-un nou
rgn.fofn.
pozitional argumente:
inCmpFile
Un fișier cmp.h5 de intrare.
inRgnFofn
Un număr de fișiere de tabel de regiune de intrare.
outRgnFofn
Un număr de fișiere de tabel de regiune de ieșire.
facultativ argumente:
-h, --Ajutor
afișați acest mesaj de ajutor și ieșiți
-v, --versiune
afișați numărul versiunii programului și ieșiți
-l FIȘIER JURNAL, --fișier jurnal FIȘIER JURNAL
Specificați un fișier la care să vă conectați. Implicit la stderr. (implicit: niciunul)
-d, --depanare
Mărește gradul de verbozitate a înregistrării (implicit: False)
-i, --info
Afișează intrările de jurnal informativ (implicit: False)
Utilizați maskAlignedReads online folosind serviciile onworks.net
