Aceasta este comanda mergere care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
fuziune - Îmbina două secvențe care se suprapun
REZUMAT
fuziune -secventa secvenţă -secventa secvenţă [-fișier de date matrixf] [-gapopen pluti]
[-gapeextend pluti] -outfile alinia -outseq seqout
fuziune -Ajutor
DESCRIERE
fuziune este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul (grupurile) de comandă „Aliniere: Consens”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-secventa secvenţă
-secventa secvenţă
-fișier de date matrixf
Acesta este fișierul matricei de scoring folosit la compararea secvențelor. Implicit este
fișierul „EBLOSUM62” (pentru proteine) sau fișierul „EDNAFULL” (pentru secvențe nucleice). Aceste
fișierele se găsesc în directorul „date” al instalării EMBOSS.
Suplimentar secțiune
-gapopen pluti
Valoare implicită: @($(acdprotein)? 50.0 : 50.0 )
-gapeextend pluti
Valoare implicită: @($(acdprotein)? 5.0 : 5.0)
producție secțiune
-outfile alinia
-outseq seqout
Utilizați mergere online folosind serviciile onworks.net
