mia-2dseriessmoothgradMAD - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

mia-2dseriessmoothgradMAD - Evaluează gradientul timp-intensitate în funcție de pixeli al unei imagini 2D
serie.

REZUMAT

mia-2dseriessmoothgradMAD -i -o [Opțiuni]

DESCRIERE

mia-2dseriessmoothgradMAD Având în vedere un set de imagini de succesiune temporală, evaluați
gaussian temporal în funcție de pixeli și evaluează-i MAD în funcție de pixeli. O prefiltrare spațială poate
să fie aplicat prin specificarea pluginurilor suplimentare (filtru/2dimage)

OPŢIUNI

-i --in-file=(intrare, obligatorie); şir
set de segmentare de intrare

-o --out-file=(ieșire, obligatorie); io
numele fișierului de ieșire Pentru tipurile de fișiere acceptate, consultați PLUGINS:2dimage/io

-k --skip=0
Omite fișierele la începutOriește fișierele la început

-e --mareste-limita=5
Măriți cropbox după numărul de pixeli Măriți cropbox după numărul de pixeli

-c --cultură
decupați imaginea înainte de a rula statisticile

-g --gauss=1
Gauss filter width for moothing the gradientgauss filter width for moothing
gradientul

Ajutor & Informație
-V --verbose=avertisment
verbozitatea rezultatelor, mesaje tipărite de nivel dat și priorități mai mari.
Prioritățile acceptate începând de la cel mai de jos nivel sunt:
info ‐ Mesaje de nivel scăzut
urmări ‐ Urmărirea apelului de funcție
eşua ‐ Raportați eșecurile testelor
de avertizare - Avertizări
eroare - Raportează erori
depana - Ieșire de depanare
mesaj ‐ Mesaje normale
fatal ‐ Raportați numai erori fatale

--drepturi de autor
tipăriți informații despre drepturile de autor

-h --ajutor
imprimați acest ajutor

-? --utilizare
imprimați un scurt ajutor

--versiune
tipăriți numărul versiunii și ieșiți

Prelucrare
--fire=-1
Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, acest număr ar trebui să fie mai mic
sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic din mașină. (-1:
estimare automată). Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, Aceasta
numărul trebuie să fie mai mic sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic în
Mașina. (-1: estimare automată).

PLUG-URI: 1d/nucleu spațial

cdiff Se utilizează nucleul de filtru de diferență centrală, condițiile de limită în oglindă.

(fara parametri)

gauss nucleul filtrului spațial Gauss, parametrii acceptați sunt:

w = 1; uint în [0, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

PLUG-URI: 1d/splinekernel

bspline Crearea nucleului B-spline, parametrii acceptați sunt:

d = 3; int în [0, 5]
Gradul spline.

omoms Crearea nucleului OMoms-spline, parametrii acceptați sunt:

d = 3; int în [3, 3]
Gradul spline.

PLUG-URI: 2dimage/combinator

absdiff Combinator de imagini „absdiff”

(fara parametri)

adăuga Combinatorul de imagini „adăugați”

(fara parametri)

div Combinator de imagini „div”

(fara parametri)

mul Combinator de imagini „mul”

(fara parametri)

sub Combinator de imagini „sub”

(fara parametri)

PLUG-URI: imagine 2d/filtru

adaptat Filtrul median adaptiv al imaginii 2D, parametrii acceptați sunt:

w = 2; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

admean Un filtru mediu adaptiv care funcționează ca un filtru mediu normal, dacă intensitatea
variația în interiorul măștii de filtru este mai mică decât variația intensității în
întreaga imagine, că folosește o formulă specială dacă variația locală este mai mare
apoi variația intensității imaginii., parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

aniso Filtru de imagine anizotrop 2D, parametrii acceptați sunt:

epsilon = 1; plutește în (0, inf)
pragul de modificare a iterației.

proces = 100; int în [1, 10000]
numărul de iterații.

k = -1; plutește în [0, 100]
k pragul de zgomot (<=0 -> adaptiv).

n = 8; a stabilit
Cartier. Valorile acceptate sunt:( 4, 8, )

psi = tuckey; dict
funcția de oprire a muchiei. Valorile acceptate sunt:
ghici ‐ testarea funcției de oprire
tuckey ‐ funcția de oprire tukey
pm1 - funcția de oprire 1
pm2 - funcția de oprire 2

bandpass filtru trece-bandă de intensitate, parametrii acceptați sunt:

max = 3.40282e+38; pluti
maxim al benzii.

minute = 0; pluti
minim al benzii.

binariza filtrul de binarizare a imaginii, parametrii acceptați sunt:

max = 3.40282e+38; pluti
maximul intervalului acceptat.

minute = 0; pluti
minim de interval acceptat.

închide Parametrii de apropiere morfologici suportati sunt:

aluzie = negru; a stabilit
un indiciu asupra conținutului principal al imaginii. Valorile acceptate sunt:( negru, alb,
)

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:2dimage/shape

combiner Combinați două imagini cu operatorul combinator dat. dacă „reverse” este setat la
false, primul operator este imaginea trecută prin conducta filtrului și
a doua imagine este încărcată din fișierul dat cu parametrul 'image' the
în momentul în care filtrul este rulat, parametrii acceptați sunt:

imagine =(intrare, obligatoriu, șir)
a doua imagine care este necesară în combinator.

op =(obligatoriu, din fabrică)
Combinatorul de imagini care urmează să fie aplicat imaginilor. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine 2d/combinator

inversa = 0; bool
inversează ordinea în care imaginile au trecut la combinator.

converti filtrul de conversie a formatului de pixeli ai imaginii, parametrii acceptați sunt:

a = 1; pluti
parametrul de conversie liniară a.

b = 0; pluti
parametrul de conversie liniară b.

Hartă = opta; dict
cartografierea conversiei. Valorile acceptate sunt:
opta ‐ aplicați o transformare liniară care mapează domeniul de intrare real la
întregul interval de ieșire
gamă ‐ aplicați transformarea liniară care mapează tipul de date de intrare
interval la intervalul de tip de date de ieșire
copiaţi ‐ copiați datele la conversie
liniar ‐ se aplică transformarea liniară x -> a*x+b
optstat ‐ aplicați o transformare liniară care se mapează pe baza mediei de intrare și
variație la întreaga gamă de ieșire

repn = ubyte; dict
tip de pixel de ieșire. Valorile acceptate sunt:
nici unul ‐ nu este definit niciun tip de pixel
pluti ‐ virgulă mobilă 32 de biți
sbyte ‐ semnat pe 8 biți
ulong ‐ nesemnat pe 64 de biți
dubla ‐ virgulă mobilă 64 de biți
Sint ‐ semnat pe 32 biți
scurt ‐ nesemnat pe 16 de biți
sscurt ‐ semnat pe 16 biți
int ‐ nesemnat pe 32 de biți
slong ‐ semnat pe 64 biți
pic ‐ date binare
ubyte ‐ nesemnat pe 8 de biți

cultură Decupați o regiune a unei imagini, regiunea este întotdeauna fixată la imaginea originală
dimensiune., parametrii acceptați sunt:

capăt = [[-1,-1]]; transmisibil în flux
sfârşitul regiunii de cultură.

Începe = [[0,0]]; transmisibil în flux
începutul regiunii de cultură.

delată Filtrul de dilatare a stivei de imagini 2D, parametrii acceptați sunt:

aluzie = negru; a stabilit
un indiciu asupra conținutului principal al imaginii. Valorile acceptate sunt:( negru, alb,
)

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:2dimage/shape

distanţă Filtrul de distanță a imaginii 2D, evaluează harta distanței pentru o mască binară.

(fara parametri)

downscale Reducerea imaginii de intrare utilizând o dimensiune de bloc dată pentru a defini reducerea reducerii
factor. Înainte de scalare, imaginea este filtrată printr-un filtru de netezire la
eliminați datele de înaltă frecvență și evitați artefactele de aliasing., acceptat
parametrii sunt:

b = [[1,1]]; 2dbounds
dimensiunea blocului.

bx = 1; uint în [1, inf)
dimensiunea blocului în direcția x.

by = 1; uint în [1, inf)
dimensiunea blocului în direcția y.

nucleu = gauss; şir
nucleul filtrului de netezire care urmează să fie aplicat, dimensiunea filtrului este estimată
pe baza dimensiunii blocului..

eroda Filtrul de erodare a stivei de imagini 2D, parametrii acceptați sunt:

aluzie = negru; a stabilit
un indiciu asupra conținutului principal al imaginii. Valorile acceptate sunt:( negru, alb,
)

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:2dimage/shape

gauss filtru gauss 2D izotrop, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [0, inf)
parametrul lățimii filtrului.

gradnorm Filtru de normă imagine 2D la gradient, parametrii acceptați sunt:

normaliza = 0; bool
Normalizați normele de gradient la intervalul [0,1]..

inversa filtru invers de intensitate

(fara parametri)

kmans Filtru K-Means de imagine 2D. În imaginea de ieșire, valoarea pixelului reprezintă
apartenența la clasă și centrele de clasă sunt stocate ca atribut în imagine.,
parametrii acceptați sunt:

c = 3; int în [2, inf)
numărul de clase.

etichetă Etichetați componentele conectate într-o imagine binară 2D. Parametrii acceptați sunt:

n = 4n; fabrică
Mască de vecinătate pentru a descrie conectivitatea.. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 2d

labelmap Filtru de imagine pentru a remapa ID-urile etichetelor. Se aplică numai imaginilor cu valori întregi
intensități/etichete., parametrii acceptați sunt:

Hartă =(intrare, obligatoriu, șir)
Etichetați fișierul de mapare.

scara de etichete
Un filtru care creează numai voxeli de ieșire care sunt deja creați în intrare
imagine. Scalare se face prin utilizarea unui algoritm de vot care selectează ținta
valoarea pixelilor bazată pe cel mai mare număr de pixeli dintr-o anumită etichetă din
regiunea sursă corespunzătoare. Dacă regiunea cuprinde două etichete cu aceeași
count, cel cu numărul mai mic câștigă., parametrii acceptați sunt:

exagerat =(obligatoriu, 2dbounds)
dimensiunea țintă dată ca două valori separate de coma.

încărca Încărcați imaginea de intrare dintr-un fișier și utilizați-o pentru a înlocui imaginea curentă în fișierul
pipeline., parametrii acceptați sunt:

fişier =(intrare, obligatoriu, șir)
numele fișierului de intrare de încărcat din...

masca Mascare 2D, una dintre cele două imagini de intrare trebuie să fie de tip bit., acceptată
parametrii sunt:

umple = min; dict
stilul de umplere pentru pixelii din afara măștii. Valorile acceptate sunt:
max ‐ setați valorile din afara măștii la valoarea maximă găsită în
imagine..
zero ‐ setați valorile din afara măștii la zero.
minute ‐ setați valorile din afara măștii la valoarea minimă găsită în
imagine.

intrare =(intrare, obligatoriu, șir)
al doilea nume de fișier imagine de intrare.

invers = 0; bool
setată la true pentru a utiliza inversul măștii pentru mascare.

maxflow Acest filtru implementează algoritmul de tăiere minimă a fluxului maxim pentru imagine
segmentare, parametrii acceptați sunt:

chiuveta-flux =(intrare, obligatoriu, șir)
Imagine de tip float pentru a defini fluxul per pixel către chiuvetă.

sursă-flux =(intrare, obligatoriu, șir)
Imagine de tip float pentru a defini fluxul per pixel către sursă.

însemna Filtrul mediu al imaginii 2D, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

mediană Filtrul median al imaginii 2D, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

MLV Filtrul de imagine 2D pentru media variației minime, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
parametrul lățimii filtrului.

ngfnorm Imagine 2D la filtru normalizat-gradiend-câmp-normă

(fara parametri)

zgomot Filtru de zgomot imagine 2D: adăugați zgomot aditiv sau modulat la o imagine, acceptat
parametrii sunt:

g = [gauss:mu=0,sigma=10]; fabrică
generator de zgomot. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:generator/noise

Mod = 0; bool
zgomot aditiv sau modulat.

deschide parametrii morfologici deschisi, suportati sunt:

aluzie = negru; a stabilit
un indiciu asupra conținutului principal al imaginii. Valorile acceptate sunt:( negru, alb,
)

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:2dimage/shape

tăiere Tăierea morfologică. Tăierea până la convergență va șterge toți pixelii, dar
bucle închise., parametrii acceptați sunt:

proces = 0; int în [1, 1000000]
Numărul de iterații de rulat, 0=până la convergență.

regiongrow
Regiunea care crește pornind de la o sămânță până doar de-a lungul unor gradiente crescătoare,
parametrii acceptați sunt:

n = 8n; fabrică
Forma de cartier. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:2dimage/shape

sămânţă =(intrare, obligatoriu, șir)
imaginea semințelor (cu valoare de biți).

sandp Filtru 3d de sare și piper, parametrii acceptați sunt:

treieră = 100; plutește în (0, inf)
valoarea pragului.

w = 1; int în [1, inf)
parametrul lățimii filtrului.

scară Filtrul de reducere a imaginii 2D, parametrii acceptați sunt:

interp = [bspline:d=3]; fabrică
metoda de interpolare care trebuie utilizată. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

s = [[0,0]]; 2dbounds
dimensiunea țintei ca vector 2D.

sx = 0; uint în [0, inf)
dimensiunea țintă în direcția x, 0: utilizați dimensiunea de intrare.

sy = 0; uint în [0, inf)
dimensiunea țintă în direcția y, 0: utilizați dimensiunea de intrare.

selectbig Eticheta 2D selectează cel mai mare filtru de componentă

(fara parametri)

sepconv Filtru de convoluție separat pentru intensitatea imaginii 2D, parametrii acceptați sunt:

kx = [gauss:w=1]; fabrică
nucleul de filtrare în direcția x. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/spacialkernel

ky = [gauss:w=1]; fabrică
nucleul de filtrare în direcția y. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/spacialkernel

shmean filtru de imagine 2D care evaluează media pentru o anumită formă de cartier,
parametrii acceptați sunt:

forma = 8n; fabrică
forma cartierului pentru a evalua media. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 2d

sobel Filtrul Sobel 2D pentru evaluarea gradientului. Rețineți că tipul de pixel de ieșire al
imaginea filtrată este aceeași cu tipul de pixel de intrare, deci conversia intrării
în prealabil la o imagine cu valoare în virgulă mobilă este recomandată., acceptat
parametrii sunt:

dir = x; dict
Direcția gradientului. Valorile acceptate sunt:
y ‐ gradient în direcția y
x ‐ gradient în direcția x

sortare-etichetă
Acest plug-in sortează etichetele unei imagini în tonuri de gri, astfel încât eticheta cea mai de jos
valoarea corespunde etichetei cu cei mai mulți pixeli. Fundalul (0) nu este
atins

(fara parametri)

saw cap de apă însămânțat. Algoritmul extrage exact atât de multe regiuni ca inițial
etichetele sunt date în imaginea semințelor., parametrii acceptați sunt:

grad = 0; bool
Interpretați imaginea de intrare ca gradient. .

marca = 0; bool
Marcați bazinele hidrografice segmentate cu o valoare specială de scară de gri.

n = [sfera:r=1]; fabrică
Cartier pentru regiunea Watershead în creștere. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 2d

sămânţă =(intrare, obligatoriu, șir)
imagine de intrare semințe care conține etichetele pentru regiunile inițiale.

reper Salvați imaginea de intrare într-un fișier și, de asemenea, treceți-o la următorul filtru,
parametrii acceptați sunt:

fişier =(ieșire, necesar, șir)
numele fișierului de ieșire pentru a salva și imaginea..

subțierea Subțierea morfologică. Subțierea până la convergență va avea ca rezultat un 8-conectat
schelet, parametrii acceptați sunt:

proces = 0; int în [1, 1000000]
Numărul de iterații de rulat, 0=până la convergență.

treieră Acest filtru setează toți pixelii unei imagini la zero care se încadrează sub un anumit nivel
prag și ai căror vecini într-o anumită formă de cartier cad și ei sub a
acest prag, parametrii acceptați sunt:

forma = 4n; fabrică
forma cartierului de luat în considerare. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 2d

treieră = 5; dubla
Valoarea pragului.

transforma Transformați imaginea de intrare cu transformarea dată., parametrii acceptați
sunt:

fişier =(intrare, obligatoriu, șir)
Numele fișierului care conține transformarea..

ws Segmentarea de bază a capului de apă, parametrii acceptați sunt:

evalgrad = 0; bool
Setați la 1 dacă imaginea de intrare nu reprezintă o imagine normală cu gradient.

marca = 0; bool
Marcați bazinele hidrografice segmentate cu o valoare specială de scară de gri.

n = [sfera:r=1]; fabrică
Cartier pentru regiunea Watershead în creștere. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 2d

treieră = 0; plutește în [0, 1)
Pragul de normă de gradient relativ. Valoarea pragului valorii reale este
thresh * (max_grad - min_grad) + min_grad. Bazine separate prin gradienți
cu o normă inferioară se vor alătura.

PLUG-URI: 2dimage/io

bmp Suport de intrare/ieșire a imaginii 2D BMP

Extensii de fișiere recunoscute: .BMP, .bmp

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, nesemnate pe 8 biți, nesemnate pe 16 biți

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

dicom Imagine 2D io pentru DICOM

Extensii de fișiere recunoscute: .DCM, .dcm

Tipuri de elemente acceptate:
semnat pe 16 biți, nesemnat pe 16 biți

exr un plugin 2dimage io pentru imagini OpenEXR

Extensii de fișiere recunoscute: .EXR, .exr

Tipuri de elemente acceptate:
32 de biți nesemnat, 32 de biți în virgulă mobilă

jpg un plugin 2dimage io pentru imagini jpeg în scala de gri

Extensii de fișiere recunoscute: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipuri de elemente acceptate:
8 biți nesemnat

png un plugin 2dimage io pentru imagini png

Extensii de fișiere recunoscute: .PNG, .png

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, nesemnate pe 8 biți, nesemnate pe 16 biți

crud Suport pentru ieșire de imagini RAW 2D

Extensii de fișiere recunoscute: .RAW, .raw

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

TIF Suport de intrare/ieșire a imaginii TIFF 2D

Extensii de fișiere recunoscute: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, nesemnate pe 8 biți, nesemnate pe 16 biți, nesemnate pe 32 de biți

vista un plugin 2dimage io pentru imagini Vista

Extensii de fișiere recunoscute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

PLUG-URI: Imagine 2d/formă

1n O formă care conține doar punctul central

(fara parametri)

4n 4n cartier formă 2D

(fara parametri)

8n 8n cartier formă 2D

(fara parametri)

dreptunghi Creator de măști în formă de dreptunghi, parametrii acceptați sunt:

umple = 1; bool
creați o formă umplută.

înălțime = 2; int în [1, inf)
înălțimea dreptunghiului.

lățime = 2; int în [1, inf)
lățimea dreptunghiului.

sferă Forma de vecinătate sferică închisă cu raza r., parametrii acceptați sunt:

r = 2; plutește în (0, inf)
raza sferei.

pătrat Creator de mască de formă pătrată, parametrii acceptați sunt:

umple = 1; bool
creați o formă umplută.

lățime = 2; int în [1, inf)
lățimea dreptunghiului.

PLUG-URI: 2dtransform/io

bBS I/uri serializate binare (neportabile) ale transformărilor 2D

Extensii de fișiere recunoscute: .bbs

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

vista Stocarea Vista a transformărilor 2D

Extensii de fișiere recunoscute: .v2dt

xml IO serializat XML a transformărilor 2D

Extensii de fișiere recunoscute: .x2dt

PLUG-URI: generator/zgomot

gauss Acest generator de zgomot creează valori aleatorii care sunt distribuite conform a
Distribuție Gaussien prin utilizarea transformării Box-Muller., suportată
parametrii sunt:

mu = 0; pluti
mijloc de distributie.

sămânţă = 0; uint în [0, inf)
setați semința aleatorie (0=init în funcție de ora sistemului).

sigma = 1; plutește în (0, inf)
derivarea standard a distribuției.

uniformă Generator de zgomot uniform folosind C stdlib rand(), parametrii acceptați sunt:

a = 0; pluti
limita inferioară dacă domeniul de zgomot.

b = 1; pluti
limită superioară dacă domeniul de zgomot.

sămânţă = 0; uint în [0, inf)
setați semința aleatorie (0=init în funcție de ora sistemului).

EXEMPLU

Evaluați imaginea MAD a casetei de delimitare care înconjoară segmentarea dintr-o serie
segment.set după aplicarea unui filtru gaussian temporal de lățime 5. Fără filtrare spațială
va fi aplicat. Caseta de delimitare va fi mărită cu 3 pixeli în toate direcțiile. Magazin
imaginea în format OpenEXR.

mia-2dseriessmoothgradMAD -i segment.set -o mad.exr -g 2 -c -e 3

AUTOR(i)

Gert Wollny

DREPTURI DE AUTOR

Acest software este Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germania și Madrid, Spania. Este vorba
FĂRĂ ABSOLUT NU GARANȚIE și o puteți redistribui conform termenilor GNU
LICENȚĂ PUBLICĂ GENERALĂ Versiunea 3 (sau ulterioară). Pentru mai multe informații rulați programul cu
opțiunea „--copyright”.

Utilizați mia-2dseriessmoothgradMAD online folosind serviciile onworks.net