Aceasta este comanda mincaverage care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
mincaverage - fișiere minc medii
REZUMAT
mincaverage [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc
DESCRIERE
Mincaverage medie fișierele minc împreună. Este permisă o serie de comportamente opționale ca
bine: pre-normalizarea volumelor, crearea unui volum de abatere standard, medie pe a
dimensiunea specificată a fișierelor de intrare.
OPŢIUNI
Rețineți că opțiunile pot fi specificate sub formă abreviată (atâta timp cât sunt unice) și
poate fi dat oriunde pe linia de comandă.
General Opțiuni
-2 Creați un fișier de ieșire în format MINC 2.0.
- clobber
Suprascrieți un fișier existent.
-noclobber
Nu suprascrieți un fișier existent (implicit).
-verbos
Imprimați informațiile despre progres pentru fiecare bucată de date copiată (implicit).
-Liniște Nu tipăriți informații despre progres.
- depanare Imprimați informații suplimentare (de exemplu, factori de normalizare).
-filelist nume de fișier
Specificați un fișier care conține o listă de nume de fișiere de intrare. Dacă este dat „-”, atunci fișier
numele sunt citite din stdin. Dacă această opțiune este dată, atunci nu ar trebui să existe nicio intrare
nume de fișiere specificate pe linia de comandă. Liniile goale din fișierul de intrare sunt
ignorat.
-max_buffer_size_in_kb dimensiunea memoriei tampon
Specificați dimensiunea maximă a bufferelor interne (în kbytes). Implicit este 4096
kbytes.
producție tip Opțiuni
Aceste opțiuni controlează precizia de stocare și dimensiunea valorilor voxelilor individuale din
fisier de iesire.
-tip fișier
Nu faceți nicio conversie de tip (implicit).
-octet Scrieți valori întregi de 8 biți.
-mic de statura Scrieți valori întregi de 16 biți.
-int Scrieți valori întregi de 32 biți.
-lung Înlocuit de -int.
-pluti Scrieți valorile cu o singură precizie în virgulă mobilă.
-dubla
Scrieți valori în virgulă mobilă cu precizie dublă.
-semnat Scrieți valorile ca numere întregi cu semn (implicit pentru scurt și lung). Ignorat pentru
tipuri de virgulă mobilă.
-nesemnat
Scrieți valorile ca numere întregi fără semn (implicit pentru octet). Ignorat pentru plutire
tipuri de puncte.
-gamă minute max
specifică intervalul valid de valori ale voxelului de ieșire în reprezentarea lor întreagă.
Implicit este intervalul complet pentru tip și semn. Această opțiune este ignorată pentru
valori în virgulă mobilă. Pentru ca acesta să aibă efect, trebuie să specificați un tip.
O medie de Opțiuni
-normaliza
Normalizați volumele la media lor globală înainte de a le face o medie (pe baza mediei
de voxeli cu valoare mai mare de 2 procente din intervalul complet peste minim).
-nenormalizeze
Nu normalizați volumele (implicit).
-sdfile sdfile.mnc
Specificați numele unui fișier de abatere standard de ieșire, care urmează să fie calculat în plus
media care se calculează în mod normal.
-weightfile weightfile.mnc
Specificați un fișier de greutate voxel cumulativ de ieșire (implicit=niciun).
-copy_header
Copiați toate informațiile de antet suplimentare din primul fișier de intrare (implicit
pentru un fișier de intrare).
-nocopy_header
Nu copiați informații suplimentare din antet (implicit pentru multe fișiere de intrare).
-avgdim dimname
Specificați numele unei dimensiuni pentru care ar trebui să facem o medie (sau să calculăm
deviație standard). Dacă se face normalizarea, se aplică totuși doar pentru separare
numai fișiere - nu se face nicio normalizare în cadrul unui fișier.
-binarizează
Binarizează volumele de intrare înainte de a calcula media. Binarizarea este făcută
prin specificarea unui interval de valori care contribuie cu 1 la medie. Normalizarea
intrarea nu este permisă la efectuarea binarizării.
-binrange minute max
Specificați intervalul de valori pentru binarizare.
-binvalue valoare
Specificați o singură valoare legală (întreg) pentru binarizare. Intervalul este setat la +/-
0.5 în jurul acestei valori pentru a obține o rotunjire eficientă a valorilor de intrare.
-ignora_mai jos valoare
Nu includeți voxeli sub această valoare în medie și sd
-ignora_mai sus valoare
Nu includeți voxeli peste această valoare în medie și sd
-podea valoare
Sinonim pentru -ignora_mai jos
-ignora_mai sus valoare
Sinonim pentru -ignora_mai sus
-greutăți
Specificați o serie de ponderi pentru mediere. Numărul de valori de ponderare trebuie
se potrivesc cu numărul de fișiere de intrare, iar valorile trebuie furnizate ca unic
argument cu virgule sau spații ca separatori. Suma greutăților nu trebuie să fie
zero. Dacă ponderile sunt utilizate cu o dimensiune medie, atunci doar un fișier de intrare poate
fi specificat.
-width_weighted
Această opțiune poate fi utilizată numai atunci când se face media pentru o dimensiune (-avgdim opțiune). Aceasta
specifică că ponderarea trebuie făcută folosind variabila lățime care corespunde
la dimensiunea medie. De exemplu, folosind -width_weighted cu -avgdim timp
va folosi variabila time-width pentru a pondera valorile.
-greutate_min valoare
Aceasta specifică greutatea minimă (numărul de volume dacă nu sunt specificate greutăți)
necesare pentru calcularea unei medii valide. Dacă greutatea cumulată pentru un voxel este
sub acest prag, media și sd-ul raportate vor fi 0. Acest lucru ar fi de obicei
fi util dacă valorile sunt excluse folosind oricare dintre -ignora opțiuni, sau prin valori NaN
în volumul (volumele) de intrare.
-min_greutate_fracție valoare
La fel ca -greutate_min, dar specificat ca o fracțiune din suma ponderilor de intrare
(sau numărul de volume de intrare, dacă nu este specificată nicio greutate).
General Opțiuni pentru toate comenzi:
-Ajutor Imprimați rezumatul opțiunilor din linia de comandă și ieșiți.
-versiune
Tipăriți numărul versiunii programului și ieșiți.
Utilizați mincaverage online folosind serviciile onworks.net
