Aceasta este comanda msbare care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
msbar - Mută o secvență
REZUMAT
msbar -secvenţă seqall -altă secvență seqall -numara întreg -punct listă -bloc listă
-codon listă -in rama boolean -minim întreg -maxim întreg -outseq seqoutall
msbar -Ajutor
DESCRIERE
msbar este un program de linie de comandă de la EMBOSS („software-ul european deschis de biologie moleculară
Suită"). Face parte din grupul (grupurile) de comandă „Nucleic:Mutation,Protein:Mutation”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-secvenţă seqall
-altă secvență seqall
Dacă doriți ca secvența mutantă rezultată să nu se potrivească cu un set de altele
secvențe, apoi puteți specifica acel set de secvențe aici. De exemplu, dacă tu
cere ca secvența mutantă să nu fie aceeași cu secvența de intrare, introduceți
secvența de intrare aici. Dacă doriți ca rezultatul să fie diferit de rezultatele anterioare ale
acest program, specificați aici secvențele de rezultate anterioare. Programul va verifica asta
rezultatul nu se potrivește cu secvențele specificate aici înainte de a-l scrie. În cazul în care o
este găsită potrivirea, apoi mutația este reluată cu o copie nouă a intrării
secvenţă. Dacă, după 10 astfel de încercări, există încă o potrivire cu setul de secvențe
dat aici, atunci secvența mutantă care se potrivește este scrisă cu un mesaj de avertizare.
Valoare implicită: asis:N
Necesar secțiune
-numara întreg
Valoare implicită: 1
-punct listă
-bloc listă
-codon listă
Tipuri de mutații de codon de efectuat. Acestea se fac numai dacă secvența este nucleică.
Suplimentar secțiune
-in rama boolean
Valoarea implicită: N
Avansat secțiune
-minim întreg
Valoare implicită: 1
-maxim întreg
Valoare implicită: 10
producție secțiune
-outseq seqoutall
Utilizați msbare online folosind serviciile onworks.net