Aceasta este comanda vcf-fix-ploidy care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
vcf-fix-ploidy - vcf-fix-ploidy
REZUMAT
pisică spart.vcf | vcf-fix-ploidie [OPŢIUNI] > fix.vcf
OPŢIUNI
-a, --asumat-sex
M sau F, necesar dacă lista nu este completă în -s
-l, --remediere probabilități
Adăugați sau eliminați probabilitățile het (nu comportamentul implicit)
-p, --ploidie
Definiția ploidiei. Valoarea implicită este afișată mai jos.
-s, --probele
Lista de sexe ale eșantionului (nume_probă [MF]).
-h, -?, --Ajutor
Acest mesaj de ajutor.
Mod implicit ploidie definiție:
ploidie => {
X => [
# Regiunile pseudoautosomale 60,001-2,699,520 și 154,931,044-155,270,560 cu
ploidie 2 { de la=>1, până la=>60_000, M=>1 }, { de la=>2_699_521, până la=>154_931_043, M=>1 },
], Y => [
# Fără chrY la femei și un exemplar la bărbați { de la=>1, la=>59_373_566, M=>1, F=>0 },
], MT => [
# MT haploid la bărbați și femele { de la=>1, până la => 16_569, M=>1, F=>1 },
],
}
Utilizați vcf-fix-ploidy online folosind serviciile onworks.net
