Aceasta este aplicația Linux numită bspipe a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca bspipe-1.3.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită bspipe cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
bspipe
Ad
DESCRIERE
BSpipe este o conductă cuprinzătoare de la controlul calității secvenței și maparea până la analiza funcțională a regiunilor metilate diferențiat:
(1) evaluarea calității succesiunii,
(2) curățare secvență,
(3) cartografiere de citire a secvenței,
(4) cuantificarea metilării,
(4) comparații ale eșantioanelor bazate pe profilul de metilare,
(5) identificarea DMR-urilor (regiuni metilate diferențiat),
(6) adnotarea DMR-urilor,
(7) analiza funcțională a genelor metilate diferențial,
(8) generarea de fișiere de intrare pentru vizualizare și
(9) suport pentru tehnologii de secvențiere avansate, cum ar fi TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it și NOMe-seq.
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
Shell Unix, Perl, S/R
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/bspipe/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
