Aceasta este aplicația Linux numită CStone a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca cstone.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită CStone cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
CStone
DESCRIERE
CStone este un asamblator de novo pentru date ARN-Seq care utilizează grafice de Bruijn ca și adnotă fiecare contig produs cu unul dintre cele trei niveluri de clasificare a graficului, indicând dacă se poate garanta sau nu că nu este himeric. Nivelurile de clasificare depind de complexitatea familiei de gene din care sunt derivate citirile. Ca produs secundar, acest lucru oferă, de asemenea, o perspectivă asupra structurii familiilor de gene subiacente care au fost secvențiate. Mai multe detalii vor fi disponibile în curând în lucrarea noastră: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
DESCRIERE
- Asamblarea de novo a datelor ARN-Seq.
- Identificarea contigurilor nehimerice.
- Compatibilitate multiplatformă.
- Borcan executabil disponibil.
- Nu sunt necesare pachete externe.
- Cod ușor de urmărit și încorporat altor instrumente.
- Informații despre complexitatea familiilor de gene subiacente.
- de Bruijn ca (mai îngăduitor) abordare.
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/cstone/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
