Aceasta este aplicația Linux numită MaxBin2 a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca MaxBin-2.2.7.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MaxBin2 cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
MaxBin2
DESCRIERE
MaxBin2 este următoarea generație de MaxBin (https://sourceforge.net/projects/maxbin/) care acceptă mai multe mostre în același timp. MaxBin este un software pentru binarea secvențelor metagenomice asamblate bazate pe un algoritm de așteptare-maximizare. Utilizatorii ar putea înțelege benzile de bază (genoamele) microbilor din metagenomul lor prin simpla furnizare de secvențe metagenomice asamblate și informații de acoperire a citirilor sau citiri de secvențiere. Pentru comoditatea utilizatorilor, MaxBin va raporta statistici legate de genom, inclusiv caracterul complet estimat, conținutul GC și dimensiunea genomului în pagina cu rezumatul binning. Utilizatorii ar putea folosi MEGAN sau software similar pe coșurile MaxBin pentru a afla taxonomia fiecărui coș după terminarea procesului de binning.Mai multe informații pot fi găsite pe site-ul oficial MaxBin: http://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html
Categorii
- Metagenomics Binning
Limbaj de programare
C ++
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/maxbin2/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
