Aceasta este aplicația Linux numită mCarts a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca mCarts.v1.2.0.tgz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită mCarts cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
mCarts
Ad
DESCRIERE
Multe RBP recunosc secvențe foarte scurte și degenerate, cu specificitatea de țintire atinsă prin mecanisme precum legarea sinergică la mai multe site-uri grupate și modularea accesibilității site-ului prin diferite structuri secundare ARN. mCarts integrează numărul și distanța dintre site-urile motive individuale, accesibilitatea și conservarea acestora, ceea ce îmbunătățește substanțial raportul semnal-zgomot. Acest algoritm învață și cuantifică regulile acestor caracteristici, profitând de un număr mare de situsuri de legare a RBP in vivo obținute din secvențierea cu randament ridicat a ARN-urilor izolate prin reticulare și imunoprecipitare (HITS-CLIP). Am aplicat acest algoritm pentru a studia două RBP reprezentative, Nova și Mbnl. În ciuda conținutului de informații foarte scăzut în elementele motive individuale, algoritmul nostru a făcut predicții foarte specifice pentru validarea experimentală de succes.
Public
Știință/Cercetare, utilizatori finali avansați
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
Perl
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/mcarts/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
