Aceasta este aplicația Linux numită MendelChecker a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca MendelChecker_v2.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MendelChecker cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
MendelChecker
Ad
DESCRIERE
MendelChecker este o măsură bazată pe probabilitate a segregării mendeliane a polimorfismelor unice de nucleotide (SNP) în pedigree-urile nucleare. Am dezvoltat această metodă ca măsură de control al calității pentru descoperirea de noi variante din date zgomotoase de secvențiere de generație următoare în pedigree, cum ar fi secvențierea ADN-ului asociată cu site-ul de restricție (RAD-seq) în organisme non-model. Această metodă implementează compararea transmisiei heterogametice vs homogametice, adică segregarea legată de sex vs. autosomal.
DESCRIERE
- Măsurați probabilitatea transmiterii mendeliane în pedigree
- Autozom vs. atribuirea cromozomilor sexuali
- Citește ieșirea GATK standard
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.