Aceasta este aplicația Linux numită MetaPhat -meta-pheno-association-tracker a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca meta_phat.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MetaPhat -meta-pheno-association-tracker cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
MetaPhat -meta-feno-asociere-tracker
DESCRIERE
MetaPhat este un instrument activ și cu sursă deschisă (licență MIT) pentru a detecta variantele cu asocieri multivariate prin utilizarea statisticilor rezumate din studiile GWAS univariate. Aplicația efectuează, de asemenea, descompunerea prin găsirea de subseturi BIC optime și trăsături de driver pentru valoarea P pentru variantele de plumb multivariate. Rezultatele variante sunt urmărite și grupate pentru a ajuta la disecția relațiilor fenotip-genotip.Vă rugăm să consultați pagina noastră wiki pentru instrucțiuni de instalare, formatele de date GWAS necesare și exemple de intrări cu comandă de testare - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Exemplu de date/sursă de gudron privind lipidele globale (GLGC, Willer 2013) - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Dacă întâmpinați probleme sau aveți solicitări de funcții după ce ați încercat un exemplu și ați citit tutorialul, vă rugăm să trimiteți un e-mail: [e-mail protejat]
Drepturi de autor <2019> [e-mail protejat], [e-mail protejat]
DESCRIERE
- analiza multivariată a trăsăturilor la nivelul genomului
- Selecția optimă a subsetului de trăsături bazată pe valoarea p și BIC
- diagrame cu urme de descompunere a trăsăturilor
- conduce SNP și fișierul rezumat al trăsăturilor conducătorului auto
- snp-snp trăsătură rank spearman cluster
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
