Aceasta este aplicația Linux numită Molecular Dynamics Studio a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca WindowsRelease.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Molecular Dynamics Studio cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
Studio de dinamică moleculară
DESCRIERE
Aceasta este o colecție de modificări software create pentru a integra NanoEngineer-1, PACKMOL și MSI2LMP cu scopul de a crea cu ușurință celule de dinamică moleculară. NanoEngineer-1 este un software CAD molecular scris de Nanorex și oferă utilizatorului o modalitate ușoară de a crea molecule, în timp ce modificările software permit utilizatorului să tasteze atomi folosind mai multe câmpuri de forță. PACKMOL poate genera o colecție aleatorie de molecule folosind șabloanele de molecule de la NanoEngineer-1, oferind astfel celula MD inițială. Modificările aduse PACKMOL permit transmiterea datelor de tip atom către software-ul MSI2LMP. MSI2LMP creează un fișier de intrare LAMMPS pe baza câmpurilor de forță de clasa I sau clasa II. MSI2LMP a fost modificat pentru a utiliza datele de câmp de forță codificate numeric generate de NanoEngineer-1. Formatul de fișier MMP a fost extins și integrat în toate cele trei aplicații software.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
DESCRIERE
- Capacitate CAD moleculară prin NanoEngineer-1
- Tastați manual atomii pe baza câmpului de forță atomistică CFF91
- Creați șabloane de molecule folosind NanoEngineer-1
- Generați o celulă MD folosind PACKMOL și șabloane de molecule multiple
- Generați un fișier de intrare geometrie LAMMPS utilizând MSI2LMP
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
OpenGL, Qt
Limbaj de programare
Fortran, Python, C++, C
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.