Aceasta este aplicația Linux numită MoPAC a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca MoPAC_0.3.1.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MoPAC cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
MoPAC
DESCRIERE
Pentru a facilita compararea esențialității genelor din două sau mai multe probe de celule, propunem MoPAC (Modular Pipeline for Analysis of CRISPR screens), un instrument interactiv condus de Shiny pentru analiza esențialității diferențiale în ecranele CRISPR/Cas9.
Pentru instrucțiuni de instalare și utilizare, vă rugăm să consultați pagina wiki.
Categorii
- Măsurarea imparțială a esențialității genelor diferențiale în ecranele CRISPR.
- Ușurință în utilizare printr-o interfață grafică interactivă de utilizator.
- Cifre gata de publicare generate la fiecare pas al analizei.
- Atât fișierele FASTQ, cât și tabelele de citire (înainte sau după normalizare) sunt permise ca intrare.
- Controlul calității bazat pe categorii de gene pentru detectarea și filtrarea valorii aberante.
- Analiza ontologiei genetice încorporată prin pachetul STRINGdb R.
- Procesare rapidă prin compilarea C++ a pașilor intensivi în calcul.
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Bazat pe Web
Limbaj de programare
C++, S/R
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/mopac/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
