Aceasta este aplicația Linux numită PARSEC - Pattern Search / Context a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca PARSEC_Deployment_Package_v2.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită PARSEC - Pattern Search / Context cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
PARSEC - CĂUTARE PATRON / Context
DESCRIERE
Caracterizarea siturilor genomice este o provocare majoră în înțelegerea și exploatarea datelor de secvențiere de generație următoare. Majoritatea site-urilor genomice sunt reprezentate de motive scurte, degenerate, cu o distribuție împrăștiată și uneori cu funcție biologică (ex: reglarea expresiei genelor, modele de splicing sau semnale epigenetice). Aceste motive sunt asociate cu o cantitate imensă de zgomot și, prin urmare, dezvoltarea unei platforme de calcul pentru detectarea precisă a site-urilor genomice necesită integrarea diferitelor date biologice la scară largă pentru a filtra falsele pozitive.
PARSEC reprezintă o soluție intuitivă, modulară (ușor extensibilă) și all-in-one pentru integrarea eficientă a multor informații genomice diverse pentru a realiza localizarea și caracterizarea neliniară a siturilor biologice într-un mediu ușor de utilizat.
Consultați wiki pentru cerințele hardware și browserele acceptate.
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Bazat pe Web
Limbaj de programare
C++, Java
Mediul bazei de date
JDBC, MySQL, PostgreSQL (pgsql)
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
