Aceasta este aplicația Linux numită pipasic a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca README.txt. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită pipasic cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
pipasic
DESCRIERE
Analiza metaproteomică permite studierea interacțiunii dintre organisme sau grupuri funcționale și a devenit din ce în ce mai populară și în scopuri de diagnostic. Cu toate acestea, apar dificultăți din cauza asemănării mari a secvenței dintre organismele înrudite. Mai mult, starea de conservare a proteinelor între specii poate fi corelată cu nivelul lor de expresie, ceea ce poate duce la o părtinire semnificativă a rezultatelor și interpretării. Aceste provocări sunt similare, dar nu identice cu provocările care apar în analiza probelor metagenomice și necesită soluții specifice.
pipasic (corecția similarității abundenței proteomului ponderat cu intensitatea peptidei) este un instrument care corectează rezultatele de cuantificare bazate pe identificare și numărare spectrală utilizând estimarea similarității peptidelor și ponderarea nivelului de expresie într-un cadru lasso nenegativ. pipasic are avantaje distincte față de abordări numai în ceea ce privește peptidele unice sau agregarea rezultatelor la cel mai mic strămoș comun.
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
Piton
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/pipasic/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
