Aceasta este aplicația Linux numită PPSeq: Parallel NGS Analysis, care se rulează online în Linux, a cărei cea mai recentă versiune poate fi descărcată ca ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită PPSeq: Parallel NGS Analysis pentru a rula gratuit în Linux online cu OnWorks.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
PPSeq: Analiza NGS paralelă pentru a rula online în Linux
DESCRIERE
Tehnologia de secvențiere de generație următoare (NGS) de mare performanță a apărut rapid ca un instrument puternic în multe aspecte ale cercetării biomedicale. Cu toate acestea, împreună cu dezvoltarea sa rapidă, mărimea datelor și complexitatea analizei pentru NGS depășesc cu mult capacitatea și capacitatea facilităților de calcul tradiționale la scară mică, cum ar fi algoritmii multithreading pe stațiile de lucru independente. Pentru a rezolva această problemă, prezentăm aici o soluție care utilizează puterea de procesare din ce în ce mai mare de către sistemele de procesare paralelă masivă (MPP).DESCRIERE
- ppalgn - alinierea citirilor de secvențiere la secvențe de referință lungi
- ppbwt - construirea unui indice FM dintr-un set de secvențe ADN
Public
Educație, Inginerie, Industria sănătății, Tehnologia informației, Organizații non-profit, Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
C ++
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/ppseq/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
