Aceasta este aplicația Linux numită Protospacer Workbench a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Protospacer Workbench cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
Banc de lucru Protospacer
DESCRIERE
Protospacer Workbench ajută la proiectarea, analizarea și partajarea site-urilor țintă CRISPR pentru orice organism sau set de secvențe formatate FASTA.Proiectarea ARN-urilor de ghidare pentru sistemul de editare a genomului CRISPR/Cas este simplă din punct de vedere intuitiv, dar dificil din punct de vedere computațional. Principala dificultate apare din necesitatea de a identifica potențialele în afara țintelor care pot fi destul de diferite de ținta vizată. Instrumentele online actuale pentru proiectarea ghid-ARN oferă o interfață ușor de utilizat pentru software-ul de cartografiere a secvenței, cum ar fi Bowtie sau BLAST. Cu toate acestea, deși sunt rapid, acești algoritmi de mapare nu au fost proiectați cu o toleranță ridicată la eroare, o caracteristică critică pentru determinarea potențialelor în afara țintelor. Acolo unde instrumentele online eșuează, instrumentele offline reușesc. Cu toate acestea, instrumentele offline necesită cunoștințe despre linia de comandă pe care puțini cei care folosesc CRISPR o au. Protospacer Workbench își propune să reducă decalajul dintre proiectarea ghid-ARN online și offline. Software-ul este disponibil momentan pentru OS X și va fi portat pe alte sisteme de operare în curând.
DESCRIERE
- Găsiți rapid toate țintele CRISPR disponibile
- Evaluați temeinic modelele ghid-ARN
- Partajați ținte și liste de ARN-ghid
- Design pentru orice organism
- Gestionați mai multe baze de date
- Flux de lucru pas cu pas
- Obțineți rapoarte despre performanța așteptată a ghidului-ARN
- Folosiți mai multe instrumente terțe dintr-o singură interfață
- Design multi-țintă
- Gestionați liste mari țintă/ghid-ARN
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
