Aceasta este aplicația Linux numită QSdpR a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca run1.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită QSdpR cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
QSdpR
Ad
DESCRIERE
Acesta este un software de reconstrucție a cvasispeciilor virale pentru problema de asamblare a cvasispeciilor pe virușii ARNm, care se bazează pe o abordare de grupare a corelației și utilizează un cadru de optimizare semidefinit. Software-ul acceptă un genom de referință, un set de citire NGS aliniat la această referință și un set de locații SNP sub forma unui fișier vcf și generează un set optim de genomi de specii reconstruite care descrie populația virală subiacentă.
Categorii
- Cvasispecie
- virusul ARNm
- clustering
- Program semidefinit
- virusul HIV-1
Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
Shell Unix, Python, C
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/qsdpr/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
