Aceasta este aplicația Linux numită qure a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca QuRe_v0.99971.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită qure cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
qure
DESCRIERE
QuRe este un program pentru reconstrucția cvasispeciilor virale, dezvoltat special pentru a analiza datele NGS de citire lungă (>100 bp). Software-ul efectuează alinieri ale fragmentelor de secvență față de un genom de referință, găsește o diviziune optimă a genomului în ferestre glisante bazate pe acoperire și diversitate și încearcă să reconstruiască toate secvențele individuale ale cvasispeciei virale - împreună cu prevalența lor - folosind o euristică algoritm, care se potrivește cu distribuțiile multinomiale ale variantelor virale distincte care se suprapun peste diviziunea genomului. QuRe vine cu o metodă de corecție a erorilor Poisson încorporată și o grupare probabilistică post-reconstrucție, ambele parametrizate pe rate de eroare date în regiunile homopolimerice și nehomopolimerice.Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/qure/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.