Aceasta este aplicația Linux numită SeqSelector a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca SeqSelector1.1b.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită SeqSelector cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SeqSelector
Ad
DESCRIERE
Setul de instrumente SeqSelector este o suită de scripturi python ușor de utilizat, independente de platformă, pentru a facilita selecția secvențelor pentru îmbogățirea țintită a bibliotecilor de generație următoare prin capturarea secvenței bazată pe hibridizare. Scripturile nu necesită cunoștințe de programare și pot fi aplicate secvențelor de genom ale speciilor model sau non-model. Sugerăm un flux de lucru în care genele de interes sunt identificate mai întâi din studiile anterioare și seturile de date disponibile public de adnotări funcționale ale genelor. Odată ce o listă de gene candidate a fost identificată, secvențele lor sunt selectate din genomul de referință. Aceste secvențe sunt folosite ca o interogare în timpul unei căutări BLAST a genomului neadnotat al unei specii non-model și apoi sunt returnate secvențele corespunzătoare, care pot fi folosite pentru a proiecta momeli pentru capturarea secvenței bazate pe hibridizare.
Limbaj de programare
Piton
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/seqselector/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
