Aceasta este aplicația Windows numită CAMPARI a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca campari_v4_12202020.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită CAMPARI cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
CAMPARI
Ad
DESCRIERE
Suntem mândri să introducem versiunea 4 a CAMPARI. Menținând filozofia introdusă cu V3 pentru a accelera (aproape) totul cu ajutorul OpenMP (paralelismul firelor), am adăugat o serie de algoritmi noi din literatura recentă, mai ales un modul întreg care se ocupă cu molecule mici de chimie arbitrară pentru aplicații în andocare computațională și proiectare de medicamente. Desigur, CAMPARI continuă să ofere implementarea de referință a paradigmei câmpului de forță ABSINTH și a modelului de solvație implicită.
CAMPARI este un pachet comun pentru efectuarea și analizarea simulărilor moleculare, în special a sistemelor cu relevanță biologică. Se concentrează pe o disponibilitate largă de algoritmi pentru eșantionarea (avansată) și este capabil să combine Monte Carlo și dinamica moleculară într-un mod perfect. CAMPARI oferă utilizatorului un nivel foarte ridicat de control asupra tuturor caracteristicilor implementate. Pentru mai multe informații și caracteristici, vă rugăm să consultați pagina de start a proiectului la http://campari.sourceforge.net.
Categorii
- Eșantionare combinată MC și MD, MD în spațiu cartezian sau torsiune / rigid-corp
- Paralelizarea eficientă OpenMP a tuturor rutinelor de bază energie/forță
- Analiză sau execuție din mers ca instrument de analiză a traiectoriei (și în paralel)
- Multe rutine de analiză încorporate (DSSP, hărți de contact, funcții de corelare a perechilor etc.)
- Suport pentru mai multe grupări structurale și algoritmi aferenti, împreună cu analizele modelului de stare Markov
- Facilitate de analiză de sine stătătoare pentru facilitățile de clustering/model de stat Markov
- Complet documentat (html) și, în plus, livrat cu 16 tutoriale
- Nivel foarte ridicat de control asupra aproape tuturor funcțiilor acceptate
- Suport larg pentru tehnicile de simulare multi-replica în paralel, cum ar fi schimbul de replici în execuția paralelă hibridă MPI/OpenMP
- Suport pentru aplicații de screening pentru molecule mici cu parametrizare parțial automată
- Suport pentru multe potențiale de polarizare (distanțe, poziții, torsiuni, structură secundară, densități spațiale, compartimentare, proprietăți polimerice)
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal
Limbaj de programare
Fortran
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/campari/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
