Это команда createChemistryHeader, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
createChemistryHeader.py - Создание заголовка SAM с помощью химии секвенирования PacBio
информация
ОПИСАНИЕ
использование: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files БАС_ФАЙЛЫ
[BAS_ФАЙЛЫ...]
input_alignment_file выходной_header_file
createChemistryHeader создает заголовок SAM, содержащий химическую информацию, используемую
Колчан.
позиционный аргументы:
input_alignment_file
Файл SAM или BAM, созданный BLASR.
выходной_заголовочный_файл
Имя файла заголовка SAM или BAM, который будет создан с информацией о химии
загружен.
необязательный аргументы:
-h, --Помогите
показать это справочное сообщение и выйти
--отлаживать
Вывести подробную информацию журнала. (по умолчанию: False)
--bas_files БАС_ФАЙЛЫ [БАС_ФАЙЛЫ...]
Файлы bas или bax, содержащие чтения, которые были выровнены в
input_alignment_file. Также может быть fofn файлов bas или bax. (по умолчанию: нет)
Используйте createChemistryHeader в Интернете с помощью сервисов onworks.net
