Это команда gt-encseq-decode, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
gt-encseq-decode - декодирует / извлекает закодированные последовательности.
СИНТАКСИС
gt Encseq декодировать (файл_последовательности | имя индекса)
ОПИСАНИЕ
-зеркальный [да | нет]
виртуально добавлять обратное дополнение каждой последовательности (по умолчанию: нет)
-без потерь [да | нет]
разрешить получение исходной последовательности без потерь (по умолчанию: нет)
-дир [string]
указать направление чтения (fwd, cpl, rev, rcl) (по умолчанию: fwd)
-синглеры [да | нет]
не используйте GtEncseqReader, а обращайтесь к каждому символу последовательности отдельно (по умолчанию:
нет)
-seq [ценностное ]
извлечь последовательность, идентифицированную ее номером (по умолчанию: не определено)
-seqrange [Начало конец]
извлекать несколько последовательных последовательностей (по умолчанию: undefined)
-выход [...]
укажите формат вывода (выберите fasta | concat) (по умолчанию: fasta)
-ассортимент [Начало конец]
конкатенированный диапазон для извлечения (подразумевает -выход CONCAT) (по умолчанию: не определено)
-сепчар [string]
укажите символ для печати как SEPARATOR (по умолчанию: |)
-Помощь
отобразить справку по основным параметрам и выйти
-help +
отобразить справку по всем параметрам и выйти
-версия
отобразить информацию о версии и выйти
СОСТАВЛЕНИЕ ОТЧЕТОВ ОШИБКИ
Сообщайте об ошибках[электронная почта защищена]>.
Используйте gt-encseq-decode онлайн с помощью сервисов onworks.net
