Это команда gt-gff3validator, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
gt-gff3validator - строго проверять данные файлы GFF3.
СИНТАКСИС
gt gff3валидатор [вариант ...] [GFF3_file ...]
ОПИСАНИЕ
-typeheck [string]
использовать онтологию, представленную в файле OBO, для проверки отношений родитель-потомок. Если нет
задан аргумент, используется файл диван.obo из каталога gtdata / obo_files. Если
дается аргумент, он используется как имя файла OBO. В случае, если такой файл
не существует .обо добавляется к аргументу и загружает получившееся имя файла из
Попытка открыть каталог gtdata / obo_files. (по умолчанию: не определено)
-xrfcheck [string]
проверьте атрибуты Dbxref и Ontology_term на предмет правильного синтаксиса в соответствии с
файл определения аббревиатуры. Если аргумент не указан, файл GO.xrf_abbs из
Используется каталог gtdata / xrf_abbr. Если указан аргумент, он используется как конкретный
имя файла для файла сокращений. В случае, если такой файл не существует,
.xrf_abbr добавляется к аргументу и загружает получившееся имя файла из
gtdata / xrf_abbr каталог. (по умолчанию: не определено)
-Помощь
отобразить справку и выйти
-версия
отобразить информацию о версии и выйти
СОСТАВЛЕНИЕ ОТЧЕТОВ ОШИБКИ
Сообщайте об ошибках[электронная почта защищена]>.
Используйте gt-gff3validator онлайн с помощью сервисов onworks.net
