Это команда hmm-assembler.pl, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
hmm-assembler.pl - модуль SNAP hmm-assembler.pl
СИНТАКСИС
хм-ассемблер.pl [-ПАРАМЕТРЫ [-БОЛЬШЕ ОПЦИЙ]] [--] [ПРОГРАММА_ARG1 ...]
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
Ассоциация после односимвольный кредита Он принял:
С аргументами: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Логическое значение (без аргументов): -r -o -x -p -t -1
Опции могут быть объединены. -- останавливает обработку опций. Место не требуется
между вариантами и их аргументами.
Опции:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] включить модель 3'UTR, требуется -a
-a [] включить модель PolyA, требуется -3
-5 [] включить 5'UTR moel, требуется -p
-p включить общую модель промотора, требуется -5
-r включить универсальную повторяющуюся модель
-o включить обратную модель ORF
-x использовать явную модель интрона продолжительности
-t включить транс-сплайсинг C.elegans, требуется -p, -5
-Z устанавливает специфичные для клады значения (червь, муха, растение)
-1 модель одного гена
-c
включить донорскую модель сращивания GC-AG
Используйте hmm-assembler.pl в Интернете с помощью сервисов onworks.net
