LAshow - Интернет в облаке

ПРОГРАММА:

ИМЯ

LAshow - отображать локальные выравнивания из файлов .las

СИНТАКСИС

Лос-Анджелесшоу [-кароУФ] [-iInt(4)] [-wInt(100)][-bInt(10)] src1: db | плотина [src2: db | плотина] выровнять: лас
[читает: ФАЙЛ | читает: диапазон ...]

ОПИСАНИЕ

Лос-Анджелесшоу создает распечатанный список локальных выравниваний, содержащихся в указанном .las
файл, откуда берутся чтения a и b src1 или src1 и src2, соответственно. Если
файл или список диапазонов чтения, тогда только перекрытия, для которых a-read находится в
отображается набор, указанный в файле или списке. Видеть БДшоу(1) для объяснения
как интерпретируются файл и список диапазонов чтения.

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ

-F Поменяйте местами символы a и b на дисплее.

-U Используйте прописные буквы для последовательности ДНК вместо строчных букв по умолчанию

-iвдавливание
Задайте отступ для отображения мультфильмов и / или выравнивания, если они требуются.
(по умолчанию: 4)

-bnum_symbols
Установите количество символов по обе стороны от выровненных сегментов в выравнивании.
отображать. (по умолчанию: 10)

-ww Этот параметр используется для режимов отображения, указанных в -a и -r. (дефолт:
100)

-o Отображать только те выравнивания, которые являются правильными перекрытиями, то есть там, где заканчивается последовательность
происходит на каждом конце выравнивания

ДИСПЛЕЙ РЕЖИМЫ
-c Мультяшный рендеринг трассы

-a -r Отображение трассы локальной трассы

Ассоциация -a вариант ставит точно w столбцов на сегмент дисплея, тогда как -r вариант
ставит точно w символы чтения в каждом сегменте дисплея. В -r режим отображения
полезно, когда нужно визуально сравнить два выравнивания с одним и тем же считыванием. Если
сочетание -c, -aкачества -r выставлены флаги, затем сначала идет мультфильм, затем -a
выравнивание, и, наконец, -r выравнивание.

Используйте LAshow онлайн с помощью сервисов onworks.net