Это команда loadPulses, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
loadPulses - информация об импульсах последовательности загрузки
СИНТАКСИС
нагрузкаИмпульсы имя_басфиле cmpFileName [кредита]
ОПИСАНИЕ
нагрузкаИмпульсы загружает информацию о последовательности импульсов, такую как расстояние между импульсами или качество
информацию в файл cmp.h5. Это позволяет анализировать кинетику и качество
информация по колонке выравнивания.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
имя_басфиле
Вход {bas, pls} .h5 или input.fofn.
cmpFileName
Файл cmp.h5 для загрузки информации о пульсе.
-метрики ценностное
Список показателей, разделенных запятыми (без пробелов).
Допустимые варианты:
WhenStarted, QualityValue, InsertionQV, MergeQV, DeletionQV, DeletionTag,
SubstitutionTag, SubstitutionQV, PreBaseFrames, IPD, StartFrame, PulseWidth,
ШиринаInFrames, Light, pkmid, ClassifierQV, PulseIndex
Параметры по умолчанию:
QualityValue, ClassifierQV, StartFrame, PulseWidth, WidthInFrames, pkmid,
ИПД
-failOnMissingData
Выйдите, если во входных данных bas.h5 или pls.h5 отсутствуют какие-либо поля данных,
требуется для загрузки метрики. Defualt - это предупреждение.
-прошить
Загружайте информацию о импульсах с помощью чтения, а не буферизации.
-биметрический
Информация о импульсе загрузки по метрике, а не по чтению. Это использует больше памяти, чем
-прошить, но может быть быстрее.
-максЭлементс ценностное
Установите ограничение на размер файла pls / bas для буферизации с помощью -биметрический (значение по умолчанию:
максимальное int). Использовать -прошить если лимит превышен.
-maxMemory ценностное
Установите предел (в ГБ) памяти для буферизации данных с помощью -биметрический (значение по умолчанию: 4
ГБ). Использовать -прошить если лимит превышен.
-метаNElements ценностное
Установить количество элементов в кэше метаданных для чтения файла bas / bax / pls.h5.
-rawNElementsценностное
Установите количество элементов в кэше необработанных данных для чтения файла bas / bax / pls.h5.
-rawChunkSize ценностное
Установите размер блока кэша необработанных данных для чтения файла bas / bax / pls.h5.
Используйте loadPulses онлайн с помощью сервисов onworks.net
