Это команда ltrsift, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
ltrsift - графический интерфейс для постобработки и классификации LTR
кандидаты на ретротранспозоны
СИНТАКСИС
ltrsift
ОПИСАНИЕ
LTRsift - это графический настольный инструмент для полуавтоматической постобработки предсказанных de novo
Аннотации ретротранспозонов LTR, например, созданные с помощью LTRharvest и LTRdigest.
КОНФИГУРАЦИЯ
ПОСЛЕДНИЕ двоичные файлы (lastal и lastdb) должны находиться в пути поиска системы. Если они
нет, можно ли указать их местоположение с помощью среды «GT_LAST_PATH»
переменная перед запуском LTRsift. То же самое относится и к локации BLAST. Использовать
«GT_BLAST_PATH», чтобы указать полный путь к исполняемому файлу «blastall».
Файлы стилей (описывающие, как выглядит линейная диаграмма возможных функций) могут быть
устанавливается через переменную среды LTRSIFT_STYLE_FILE. Создается разумный стиль по умолчанию
в LTRsift.
Используйте ltrsift онлайн с помощью сервисов onworks.net
