Это команда maskAlignedReads, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
maskAlignedReads.py - чтение с выравниванием по маске в файле регионов
ОПИСАНИЕ
использование: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Используйте in.cmp.h5, чтобы замаскировать соответствующие области файлов в in.rgn.h5, запишите вывод в новый
ргн.фофн.
позиционный аргументы:
inCmpFile
Входной файл cmp.h5.
inRgnFofn
Список файлов таблиц области ввода.
outRgnFofn
Список файлов таблиц области вывода.
необязательный аргументы:
-h, --Помогите
показать это справочное сообщение и выйти
-v, --версия
показать номер версии программы и выйти
-l ЛОГ-ФАЙЛ, --лог-файл ЛОГ-ФАЙЛ
Укажите файл для входа. По умолчанию stderr. (по умолчанию: нет)
-d, --отлаживать
Увеличивает подробность ведения журнала (по умолчанию: False)
-i, --Информация
Отображать информативные записи журнала (по умолчанию: False)
Используйте maskAlignedReads онлайн с помощью сервисов onworks.net
