minclookup - Интернет в облаке

ПРОГРАММА:

ИМЯ

minclookup - преобразование таблицы поиска в файлы minc

СИНТАКСИС

минклокап [ ] .mnc .mnc

ОПИСАНИЕ

Минклоукуп выполнит операцию таблицы поиска для каждого вокселя файла minc. A lookup
Таблица состоит из списка входных значений с соответствующими выходными значениями. Каждый воксель
входной файл находится в поисковой таблице, и записывается соответствующее выходное значение.
Эти выходные значения могут быть скалярными или векторными, например, поиск цвета
таблица будет иметь четыре столбца: один столбец для входных значений и один столбец для каждого красного цвета,
зеленые и синие выходные значения.

Таблицы подстановки могут принимать одну из двух форм: (CIJ) or дискретный.

Таблица непрерывного поиска предназначена для обработки значений вокселей как непрерывных (реальных) значений и
преобразование значений путем интерполяции между значениями, указанными в таблице поиска. А
дискретная таблица поиска обрабатывает входные значения как целые числа и обрабатывает их как полностью
независимые записи, без интерполяции.

Чаще всего таблицы непрерывного поиска используются для преобразования значений интенсивности в
Цвета RGB. Чтобы упростить поисковые таблицы, все входные значения масштабируются в
диапазон от нуля до единицы. По умолчанию наименьшее значение в файле сопоставляется нулю, а наибольшее значение
соответствует одному. Затем это значение находится в поисковой таблице, обычно между двумя записями в
таблица (таблица всегда сортируется в порядке возрастания входных значений). Линейный
затем выполняется интерполяция для каждого выходного столбца, и результирующее значение (или значения)
записывается в выходной файл. Если на каждое входное значение приходится более одного выходного значения, тогда
в выходной файл добавляется измерение vector_dimension с длиной, равной числу
выходных столбцов в поисковой таблице. Для входных значений вне диапазона от нуля до единицы
используется ближайшее табличное значение.

Дискретные справочные таблицы обычно используются для переназначения значений меток. Каждое входное значение
рассматривается как целое число (не масштабируется), и если оно найдено в таблице поиска, то
соответствующее значение (или значения) записывается в выходной файл. Если не найден,
затем записывается нулевое значение (по умолчанию ноль). Никакая интерполяция не выполняется с дискретными
таблицы поиска - чтобы получить ненулевое выходное значение, в таблице должна быть запись.

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ

Обратите внимание, что параметры могут быть указаны в сокращенной форме (если они уникальны) и
можно указать в любом месте командной строки.

Общие кредита

-2 Создайте выходной файл в формате MINC 2.0.

-слобер
Перезаписать существующий файл.

-ноклоббер
Не перезаписывать существующий файл (по умолчанию).

-no_clobber
Синоним для -ноклоббер.

-подробный
Распечатайте информацию о ходе выполнения для каждого скопированного фрагмента данных (по умолчанию).

-тихо Не распечатывайте информацию о ходе выполнения.

-размер буфера размер
Укажите максимальный размер внутренних буферов (в килобайтах). По умолчанию 10 МБ.

-тип файла
Создайте выходной файл того же типа, что и первый входной файл (по умолчанию).

-байт Сохраните каждый воксель как 8-битное целое число.

-Short Сохраните каждый воксель как 16-битное целое число.

-инт Сохраните каждый воксель как 32-битное целое число.

-долго Заменено -инт.

-плавать Храните каждый воксель в 32-битном формате с плавающей запятой.

-double
Храните каждый воксель в 64-битном формате с плавающей запятой.

-подписанный
Создайте выходной файл с данными, хранящимися в подписанном виде. Эта опция бессмысленна
при использовании с форматами данных с плавающей запятой, которые всегда подписаны.

- неподписанный
Создайте выходной файл с данными, хранящимися в беззнаковом типе. Этот вариант
бессмысленно при использовании с форматами данных с плавающей запятой.

-valid_range мин Макс
Масштабировать целочисленные значения вокселей, чтобы они попадали между значениями мин и Макс. По умолчанию
целочисленные значения вокселей будут масштабированы для использования всего диапазона базового типа. Этот
опция не имеет смысла при использовании с форматами данных с плавающей запятой.

Поиск ТАБЛИЦЫ кредита

-серый Используйте серую справочную таблицу для записи значений RGB (по умолчанию).

-серый Синоним для -серый.

-горячий металл
Используйте справочную таблицу горячего металла, чтобы записать значения RGB.

-спектральный
Используйте спектральную (радужную) таблицу поиска, чтобы записать значения RGB.

-инвертировать
Инвертируйте таблицу поиска так, чтобы максимальное значение соответствовало нулю, а минимальное.
значение отображается в единицу. Применяется только к таблицам непрерывного поиска.

-не инвертировать
Не переворачивайте справочную таблицу - минимум соответствует нулю, а максимум соответствует
один (по умолчанию).

-ассортимент мин Макс
Укажите диапазон значений, которые должны отображаться в диапазоне таблицы поиска
(по умолчанию это полный диапазон входного файла).

-минимум мин
Укажите входное значение, которое соответствует минимальному значению в таблице поиска.

-максимум Макс
Укажите входное значение, которое соответствует максимальному значению в таблице поиска.

-Справочная таблица [файл | -]
Укажите имя файла, содержащего таблицу поиска. Если - дан поиск
таблица читается со стандартного ввода. В файле должно быть не менее двух столбцов:
первый столбец дает входные значения; другие столбцы дают соответствующие
выходные значения. Для непрерывной таблицы поиска первый столбец должен содержать
значение от нуля до единицы включительно Явные записи как для нуля, так и для единицы должны
обычно дается. Для дискретной таблицы поиска первый столбец должен содержать
целочисленные значения. Если указано более одного выходного столбца, выходной файл будет
иметь размер вектор_размерность длиной, равной количеству выходных
столбцы. При необходимости строки таблицы будут отсортированы так, чтобы первые
столбец в порядке возрастания.

-lut_string строка-поисковой таблицы
Задайте полную таблицу поиска как одну строку. Символ точки с запятой ";"
используется для разделения строк.

-прерывный
Таблица поиска является непрерывной (см. Описание выше): входные значения обрабатываются как
непрерывные (реальные) значения и масштабируются до диапазона от нуля до единицы перед тем, как
посмотрел вверх; интерполяция выполняется между значениями в таблице. Это по умолчанию
поведение.

-дискретный
Таблица поиска является дискретной (см. Описание выше): входные значения обрабатываются как
целые числа, и интерполяция между входными значениями не выполняется.

-null_value строка нулевого значения
Укажите нулевое значение, которое будет использоваться с дискретными справочными таблицами, когда значение не
найдено в поисковой таблице. Это значение должно быть указано в виде списка, разделенного запятыми.
значений, с тем же количеством значений, что и выходные столбцы в таблице поиска.

Общий кредита для Найти команды:

-Помощь Распечатайте сводку параметров командной строки и выйдите.

-версия
Выведите номер версии программы и выйдите.

ПРИМЕРЫ

Чтобы получить RGB-изображения горячего металла из файла МРТ:

minclookup -hotmetal input.mnc output.mnc

Чтобы преобразовать метки в файл меток minc, используйте -discrete:

minclookup -discrete -lookup_table файл поиска \
in_labels.mnc out_labels.mnc

где lookupfile - это файл, содержащий записи для сопоставления меток 2 - 4 и меток 3 - 5:

2 4
3 5

Вы также можете указать эту таблицу поиска в командной строке:

minclookup -discrete -lut_string '2 4; 3 5' \
in_labels.mnc out_labels.mnc

Чтобы получить файл RGB серого цвета, с красным для значений меньше минимального и зеленым для значений
больше минимума, вы можете дать две нулевые записи и две записи с единицей. Первое
ноль используется для отрицательных значений, второй ноль используется для интерполяции к следующему
Вход. Нет никакой двусмысленности в том, как обрабатывать значение, равное нулю, потому что первый
и последние значения таблицы обрабатываются особым образом, чтобы убедиться, что они
рассматривается как находящийся в пределах допустимого диапазона, если возникает такая ситуация с двумя входами.

minclookup -lookup_table - input.mnc output.mnc <
0 1 0 0
0 0 0 0
1 1 1 1
1 0 1 0
EOF

Чтобы инвертировать скалярное изображение, вы можете использовать minclookup:

minclookup -lut_string '0 1; 1 0' in.mnc out.mnc

Используйте minclookup онлайн с помощью сервисов onworks.net