Это команда rdp-alignment, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
rdp-alignment: - Пакет инструментов для выравнивания Ribosomal Database Project (RDP)
СИНТАКСИС
rdp-выравнивание
ОПИСАНИЕ
Пакет инструментов для выравнивания содержит команды для попарного анализа определенного сообщества.
выравнивание и скрытая марковская модель (модели HMMER3, без обучения).
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
Список стран, подкоманды:
согласование-слияние
- Объединить выравнивания
попарно-knn
- Вычислить k-ближайших соседей путем попарного выравнивания
тип-ошибки сравнения
- Обнаружение ошибок вставки, удаления и замены в последовательностях по сравнению с
ссылочные последовательности
выровнять ядро-прот
- Перенести выравнивание последовательностей из белковых последовательностей в нуклеотидные последовательности
rm-partialseq
- удалить частичные последовательности на основе попарного выравнивания с референсными последовательностями
Используйте rdp-alignment онлайн с помощью сервисов onworks.net
