Это команда xtractore, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
xtractore - извлечь последовательности, соответствующие аннотированным объектам из заданной последовательности
файл
СИНТАКСИС
экстрактор [кредита] особенности.gff3 sequence.fasta
ОПИСАНИЕ
Опции:
-d| --debug
распечатать отладочную информацию
-h| --help
распечатайте это справочное сообщение и выйдите
-i| --idfile: ФАЙЛ
файл, содержащий список идентификаторов объектов (по 1 в строке без пробелов); если предусмотрено,
будут извлечены только объекты с идентификаторами в этом файле
-o| --outfile: ФАЙЛ
файл, в который будут записываться выходные последовательности; по умолчанию - терминал (stdout)
-t| --type: STRING
тип объекта для извлечения; можно использовать несколько раз для извлечения функций из нескольких
Типы
-v| --version
распечатать номер версии и выйти
-V| --verbose
печатать подробные предупреждения и сообщения об ошибках
-w| --width: INT
ширина каждой строки последовательности в выводе Fasta; по умолчанию 80; установить на 0 для нет
форматирование
Используйте xtractore онлайн с помощью сервисов onworks.net