Это приложение для Linux под названием ADOMA, последнюю версию которого можно загрузить как adoma-1.0.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием ADOMA с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
АДОМА
ОПИСАНИЕ
ADOMA означает: Альтернативное отображение множественного выравнивания. ADOMA может создавать четыре различных отображения множественного выравнивания последовательностей: выравнивание ClustalW в формате HTML, упрощенное выравнивание ClustalW в формате HTML и / или txt и цветное выравнивание ClustalW в формате HTML. Примеры этих выходных файлов смотрите на скриншотах. ADOMA использует ClustalW для создания множественного выравнивания из последовательностей ДНК или белков и отображает их несколько иначе, чем обычный вывод ClustalW. ADOMA - это программа командной строки, которую можно легко использовать в конвейерах.
Для получения дополнительной информации посетите README.md в разделе «Файлы».
Как цитировать ADOMA:
Заал, Д. и Нота, Б. (2016), ADOMA: Инструмент командной строки для изменения вывода множественного выравнивания ClustalW. Мол. Инф., 35: 42–44. DOI: 10.1002 / minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Оболочка Unix, Python
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/adoma/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.