Это приложение для Linux под названием ArtificialFastqGenerator, последний выпуск которого можно загрузить как ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием ArtificialFastqGenerator с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Искусственный генератор Fastq
Ad
ОПИСАНИЕ
ArtificialFastqGenerator принимает эталонный геном (в формате FASTA) в качестве входных данных и выводит искусственные файлы FASTQ в формате Sanger. Он может принимать базовые оценки качества Phred из существующих файлов FASTQ и использовать их для имитации ошибок секвенирования. Поскольку искусственные FASTQ происходят из эталонного генома, эталонный геном обеспечивает золотой стандарт для вызова вариантов (однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), а также вставки и делеции (инделения)). Это позволяет оценить конвейер анализа секвенирования следующего поколения (NGS), который сопоставляет чтения с эталонным геномом, а затем вызывает варианты.Аудитория
Здравоохранение, Наука / Исследования, Продвинутые конечные пользователи
Язык программирования
Java
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.