Это приложение для Linux под названием bspipe, последнюю версию которого можно загрузить как bspipe-1.3.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием bspipe с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
bpipe
Ad
ОПИСАНИЕ
BSpipe - это комплексный конвейер от контроля качества последовательностей и картирования до функционального анализа дифференциально метилированных областей:
(1) оценка качества последовательности,
(2) последовательность очистки,
(3) отображение последовательности чтения,
(4) количественное определение метилирования,
(4) сравнение образцов на основе профиля метилирования,
(5) идентификация DMR (дифференциально метилированные области),
(6) аннотация DMR,
(7) функциональный анализ дифференциально метилированных генов,
(8) создание входных файлов для визуализации и
(9) поддержка передовых технологий секвенирования, таких как TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it и NOMe-seq.
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Оболочка Unix, Perl, S / R
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/bspipe/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
