Это приложение для Linux под названием CaptureProbe, последний выпуск которого можно загрузить как Runningexample.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием CaptureProbe с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Захват Зонда
Ad
ОПИСАНИЕ
Здесь мы разработали CaptureProbe, удобный графический инструмент Java для проектирования датчиков захвата для приложений Capture Hi-C. CaptureProbe прост в использовании, требуются только простые входные файлы и предоставляет множество параметров для проектирования зондов. CaptureProbe может разрабатывать зонды специально для геномных сайтов и интересующих геномных областей. Сравнение с существующим программным обеспечением (HiCapTools и GOPHER) показало, что CaptureProbe имеет хороший коэффициент успешности проектирования и лучшую специфичность зонда.
Цитирование: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: Java-инструмент для разработки зондов для приложений Hi-C захвата. Zool Res [J], 41: 94-96.
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/captureprobe/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
