Это приложение для Linux под названием ChIP-RNA-seqPRO для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как cloudclientID.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием ChIP-RNA-seqPRO, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
ChIP-RNA-seqPRO для запуска в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
ChIP-RNA-seqPRO: стратегия для выявления областей эпигенетической дерегуляции, связанных с аберрантным сплайсингом транскриптов и сайтами редактирования РНК. Готовые сценарии Python, упакованные вместе с настраиваемыми библиотеками аннотаций, вводом демонстрационных данных и руководством README.9 сентября: v26 Обновлен MAIN_IV для отладки ошибки, вызванной python pandas, больше не поддерживающим «подмножество».
Этот код больше не будет активно поддерживаться / обновляться здесь. Теперь доступен облачный ресурс для сравнительного анализа наборов данных эпигенетики, вариации последовательностей и экспрессии. Посетите Cloudomics, проект облачных ресурсов: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Особенности
- Инструмент для сравнительного анализа широкого спектра наборов парных выборок эпигеномных (ChIPseq, MBDseq и т. Д.) И секвенирования на основе РНК
- Если вы используете этот инструмент или любую из библиотек аннотаций, включите следующую ссылку: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila Дж., Мур Р., Наир А., О'Брайен Д., Чжу Ю., Кортум К., Ордог Т., Чжан З., Джозеф Р., Кочер Дж., Йонаш Э., Робертсон К., Тибес Р. и Х. Хо Т. (2015). Стратегии биоинформатики для выявления областей эпигенетической дерегуляции, связанной с аберрантным сплайсингом транскриптов и редактированием РНК. В материалах Международной конференции по моделям, методам и алгоритмам биоинформатики, страницы 163-170. DOI: 10.5220 / 0005248001630170
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
Оболочка Unix, Python
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
