Это приложение для Linux под названием CStone, последний выпуск которого можно загрузить как cstone.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием CStone с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Cstone
ОПИСАНИЕ
CStone - это de novo ассемблер для данных RNA-Seq, который использует графы, подобные де Брейну, и аннотирует каждый созданный контиг с одним из трех уровней классификации графов, указывая, можно ли гарантировать, что он не химерный. Уровни классификации зависят от сложности семейства генов, из которого получены считывания. В качестве побочного продукта это также дает представление о структурном составе основных семейств генов, которые были секвенированы. Более подробная информация будет вскоре доступна в нашем документе: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
Особенности
- Сборка de novo данных RNA-Seq.
- Идентификация нехимерных контигов.
- Кросс-платформенная совместимость.
- Доступен исполняемый jar-файл.
- Никаких внешних пакетов не требуется.
- Код легко отслеживать и внедрять в другие инструменты.
- Информация о сложности основных семейств генов.
- де Брюйну нравится (более снисходительный) подход.
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/cstone/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
