Это приложение для Linux под названием JSiteDescriptor, последнюю версию которого можно загрузить как binaries.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием JSiteDescriptor с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
JSiteдескриптор
Ad
ОПИСАНИЕ
Набор программ java, извлекающих координатную и химическую информацию из файлов PDB.
Области сайта связывания извлекаются с использованием схемы на основе сетки.
Для сайта связывания создается пространственно-химический дескриптор на основе алгоритма PocketMatch доктора Калидаса (также автора этого проекта).
Особенности
- Генерация векторного дескриптора на основе PocketMatch для сайта привязки
- Запуск в режиме одного файла PDB или в пакетном режиме
- Спецификация сайта как окрестности лиганда - (код лиганда, имя и идентификатор цепи)
- Спецификация сайта как окрестности подмножества PDB с использованием ОБЫЧНЫХ ВЫРАЖЕНИЙ
- Спецификация нескольких диапазонов атомов, выстилающих сайт связывания
- Файл обработки пакетного режима захватывает входные параметры через файл XML + в соответствии со спецификацией XSD
- Большая настраиваемость - выбор группы остатков, радиус и категории для сайтов
- Технология Java Swing для графического интерфейса пользователя
- Простая и расширяемая архитектура программного обеспечения для будущего развития
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Java-свинг
Язык программирования
Java
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
