Это приложение для Linux под названием mCarts, последнюю версию которого можно загрузить как mCarts.v1.2.0.tgz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием mCarts с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
mCarts
Ad
ОПИСАНИЕ
Многие RBP распознают очень короткие и вырожденные последовательности, при этом специфичность нацеливания достигается за счет таких механизмов, как синергетическое связывание с множеством кластерных сайтов и модуляция доступности сайта через различные вторичные структуры РНК. mCarts объединяет количество и расстояние между отдельными участками с мотивами, их доступность и сохранность, что значительно улучшает соотношение сигнал / шум. Этот алгоритм изучает и количественно определяет правила этих свойств, используя преимущества большого количества сайтов связывания RBP in vivo, полученных в результате высокопроизводительного секвенирования РНК, выделенных перекрестным связыванием и иммунопреципитацией (HITS-CLIP). Мы применили этот алгоритм для изучения двух репрезентативных RBP, Nova и Mbnl. Несмотря на очень низкое содержание информации в отдельных элементах мотива, наш алгоритм сделал очень конкретные прогнозы для успешной экспериментальной проверки.
Аудитория
Наука / Исследования, Продвинутые конечные пользователи
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Perl
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/mcarts/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
