Это приложение для Linux под названием MoPAC, последнюю версию которого можно загрузить как MoPAC_0.3.1.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием MoPAC с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
МОПАК
ОПИСАНИЕ
Чтобы упростить сравнение эссенциальности генов в двух или более образцах клеток, мы предлагаем MoPAC (модульный конвейер для анализа скринингов CRISPR), управляемый Shiny интерактивный инструмент для дифференциального анализа эссенциальности в скринингах CRISPR/Cas9.
Инструкции по установке и использованию см. на вики-странице.
Особенности
- Беспристрастное измерение эссенциальности дифференциальных генов при скрининге CRISPR.
- Простота использования благодаря интерактивному графическому пользовательскому интерфейсу.
- Готовые к публикации цифры генерируются на каждом этапе анализа.
- В качестве входных данных разрешены как файлы FASTQ, так и таблицы количества прочтений (до или после нормализации).
- Контроль качества на основе категорий генов для обнаружения и фильтрации выбросов.
- Генный онтологический анализ, встроенный в пакет STRINGdb R.
- Быстрая обработка за счет компиляции C++ шагов, требующих большого объема вычислений.
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Веб-
Язык программирования
C ++, S / R
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/mopac/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
