Это приложение для Linux под названием pipasic, последнюю версию которого можно загрузить как README.txt. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием pipasic с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
пипасный
ОПИСАНИЕ
Метапротеомный анализ позволяет изучать взаимодействие организмов или функциональных групп и становится все более популярным также в диагностических целях. Однако трудности возникают из-за высокого сходства последовательностей между родственными организмами. Кроме того, степень сохранности белков у разных видов может коррелировать с уровнем их экспрессии, что может привести к значительному смещению результатов и интерпретации. Эти проблемы похожи, но не идентичны проблемам, возникающим при анализе метагеномных образцов, и требуют конкретных решений.
pipasic (коррекция сходства протеома, взвешенная по интенсивности пептидов) - это инструмент, который корректирует результаты количественной оценки, основанные на идентификации и спектральном подсчете, с использованием оценки сходства пептидов и взвешивания уровня экспрессии в неотрицательной структуре лассо. pipasic имеет явные преимущества перед подходами, касающимися только уникальных пептидов или результатов агрегирования с наименьшим общим предком.
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Питон
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/pipasic/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
