Это приложение для Linux под названием PPSeq: Parallel NGS Analysis для запуска в Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием PPSeq: Parallel NGS Analysis, чтобы запускать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
PPSeq: параллельный анализ NGS для запуска в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
Технология высокопроизводительного секвенирования следующего поколения (NGS) быстро стала мощным инструментом во многих аспектах биомедицинских исследований. Однако, наряду с его быстрым развитием, объем данных и сложность анализа для NGS намного превышают емкость и возможности традиционных маломасштабных вычислительных средств, таких как многопоточные алгоритмы на автономных рабочих станциях. Чтобы решить эту проблему, мы представляем решение, использующее постоянно увеличивающуюся вычислительную мощность систем массовой параллельной обработки (MPP).Особенности
- ppalgn - выравнивание чтения секвенирования с длинными ссылочными последовательностями
- ppbwt - построение FM-индекса из набора последовательностей ДНК
Аудитория
Образование, инженерия, здравоохранение, информационные технологии, некоммерческие организации, наука и исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
C + +
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/ppseq/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
