Это приложение для Linux под названием Protospacer Workbench, последний выпуск которого можно загрузить как Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Protospacer Workbench с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Верстак Protospacer
ОПИСАНИЕ
Protospacer Workbench помогает разрабатывать, анализировать и обмениваться сайтами-мишенями CRISPR для любого организма или набора последовательностей в формате FASTA.Дизайн направляющих РНК для системы редактирования генома CRISPR / Cas интуитивно прост, но сложен с точки зрения вычислений. Основная трудность возникает из-за необходимости идентифицировать потенциальные нецелевые объекты, которые могут сильно отличаться от намеченной цели. Современные онлайн-инструменты для проектирования направляющих РНК предоставляют удобный интерфейс для программного обеспечения для картирования последовательностей, такого как Bowtie или BLAST. Однако, будучи быстрыми, эти алгоритмы картирования не были разработаны с высокой устойчивостью к ошибкам, что имеет решающее значение для определения потенциальных отклонений от цели. Там, где онлайн-инструменты терпят неудачу, оффлайн-инструменты добиваются успеха. Однако автономные инструменты требуют знания командной строки, которым обладают немногие, использующие CRISPR. Protospacer Workbench направлен на устранение разрыва между интерактивным и автономным дизайном руководств по РНК. Программное обеспечение в настоящее время доступно для OS X и скоро будет перенесено на другие операционные системы.
Особенности
- Быстрый поиск всех доступных целей CRISPR
- Тщательно оцените конструкции направляющих РНК
- Совместное использование целей и списков направляющих РНК
- Дизайн для любого организма
- Управляйте несколькими базами данных
- Пошаговый рабочий процесс
- Получайте отчеты об ожидаемой производительности РНК-проводника
- Используйте несколько сторонних инструментов из одного интерфейса
- Многоцелевой дизайн
- Управление большими списками целевых / направляющих РНК
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
