Это приложение для Linux под названием Pysimony для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как Pysimony.py. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Pysimony, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Pysimony для запуска в Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
ОБНОВЛЕНИЕ: после исправления некоторых ошибок я отказался от Pysimony для Javamony: https://sourceforge.net/projects/javamony/Учитывая красоту Python, я знаю, что когда-нибудь мне придется закончить Pysimony.
Первая попытка студента создать программу филогенетического вывода, написанную на упрощенном, но элегантном языке Python.
Pysimony читает файл FASTA (принимается только ATGC), указанный в качестве его единственного аргумента. Базовое тестирование показало, что это медленно, неточно и определенно неэффективно. Дерево, которое вряд ли будет самым экономным, печатается по завершении в базовом формате дерева Ньюика.
Поскольку все части программы являются оригинальной работой начинающего программиста, это может представлять собой один из худших подходов к решению филогенетической проблемы. Я явно избегал объектно-ориентированного программирования.
Тем не менее, я распространяю это, воображая, что когда-нибудь это может быть немного образовательным или, по крайней мере, посмеяться над жалкой попыткой изобретать велосипед.
Особенности
- Калькулятор некорректной экономии
- Читает файлы FASTA (только ATGC)
- Выводит дерево в формате Ньюика
- Простой, одиночный режим
Аудитория
Наука / Исследования, Образование
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Питон
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/pysimony/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.