Это приложение для Linux под названием Subread, последний выпуск которого можно загрузить как subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Subread с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Подчитать
Ad
ОПИСАНИЕ
Программный пакет Subread представляет собой набор инструментов для обработки данных секвенирования следующего поколения. Он включает в себя выравниватель Subread, детектор экзон-экзонного соединения Subjunc и программу суммирования чтения featureCounts.
Выравниватель subread может использоваться для выравнивания считываний как gDNA-seq, так и RNA-seq. Выравниватель субъюнка был разработан для обнаружения соединения экзон-экзон. Для отображения чтения RNA-seq Subread выполняет локальное выравнивание, а Subjunc выполняет глобальное выравнивание. Subread и Subjunc были опубликованы в следующей статье: Ян Ляо, Гордон К. Смит и Вэй Ши. «Выравниватель Subread: быстрое, точное и масштабируемое отображение чтения по принципу« затравка и голосование »», Nucleic Acids Research, 2013, 41 (10): e108
Особенности
- читать выравниватель
- секвенирование следующего поколения
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
C
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/subread/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
